Protein–RNA interactions for Protein: P62717

Rpl18a, 60S ribosomal protein L18a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl18aP62717 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rpl18aP62717 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl18aP62717 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl18aP62717 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl18aP62717 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl18aP62717 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl18aP62717 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl18aP62717 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl18aP62717 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl18aP62717 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl18aP62717 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl18aP62717 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl18aP62717 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl18aP62717 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl18aP62717 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl18aP62717 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl18aP62717 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl18aP62717 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl18aP62717 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl18aP62717 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl18aP62717 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl18aP62717 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl18aP62717 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl18aP62717 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl18aP62717 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl18aP62717 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl18aP62717 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl18aP62717 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl18aP62717 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl18aP62717 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl18aP62717 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl18aP62717 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl18aP62717 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl18aP62717 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl18aP62717 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl18aP62717 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl18aP62717 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl18aP62717 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl18aP62717 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl18aP62717 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl18aP62717 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl18aP62717 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl18aP62717 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl18aP62717 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl18aP62717 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl18aP62717 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl18aP62717 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl18aP62717 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl18aP62717 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl18aP62717 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl18aP62717 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl18aP62717 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl18aP62717 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl18aP62717 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl18aP62717 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl18aP62717 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Rpl18aP62717 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Rpl18aP62717 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
Rpl18aP62717 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Rpl18aP62717 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Rpl18aP62717 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Rpl18aP62717 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Rpl18aP62717 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Rpl18aP62717 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Rpl18aP62717 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Rpl18aP62717 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.7 ms