Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps5P59438 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hps5P59438 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hps5P59438 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Hps5P59438 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps5P59438 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps5P59438 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hps5P59438 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hps5P59438 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hps5P59438 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hps5P59438 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms