Protein–RNA interactions for Protein: P51682

Ccr5, C-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr5P51682 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccr5P51682 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccr5P51682 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms