Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LmnaP48678 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
LmnaP48678 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
LmnaP48678 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LmnaP48678 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LmnaP48678 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LmnaP48678 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LmnaP48678 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LmnaP48678 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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