Protein–RNA interactions for Protein: P47963

Rpl13, 60S ribosomal protein L13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13P47963 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl13P47963 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms