Protein–RNA interactions for Protein: P47226

Tes, Testin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TesP47226 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TesP47226 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
TesP47226 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TesP47226 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TesP47226 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
TesP47226 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TesP47226 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TesP47226 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TesP47226 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TesP47226 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TesP47226 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TesP47226 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TesP47226 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TesP47226 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TesP47226 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TesP47226 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TesP47226 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TesP47226 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TesP47226 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TesP47226 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TesP47226 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TesP47226 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TesP47226 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TesP47226 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TesP47226 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TesP47226 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TesP47226 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TesP47226 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TesP47226 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TesP47226 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TesP47226 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TesP47226 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TesP47226 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TesP47226 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
TesP47226 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TesP47226 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TesP47226 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TesP47226 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TesP47226 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TesP47226 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TesP47226 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TesP47226 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TesP47226 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
TesP47226 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TesP47226 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TesP47226 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TesP47226 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TesP47226 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TesP47226 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TesP47226 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TesP47226 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TesP47226 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
TesP47226 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TesP47226 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TesP47226 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TesP47226 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TesP47226 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TesP47226 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TesP47226 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TesP47226 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TesP47226 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TesP47226 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TesP47226 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TesP47226 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TesP47226 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TesP47226 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TesP47226 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TesP47226 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TesP47226 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TesP47226 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TesP47226 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TesP47226 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TesP47226 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TesP47226 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TesP47226 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TesP47226 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TesP47226 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TesP47226 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TesP47226 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TesP47226 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TesP47226 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TesP47226 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TesP47226 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TesP47226 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TesP47226 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TesP47226 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TesP47226 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TesP47226 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TesP47226 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TesP47226 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TesP47226 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TesP47226 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TesP47226 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
TesP47226 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
TesP47226 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
TesP47226 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
TesP47226 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
TesP47226 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
TesP47226 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TesP47226 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms