Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TtlP38585 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TtlP38585 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TtlP38585 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TtlP38585 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TtlP38585 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TtlP38585 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TtlP38585 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
TtlP38585 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TtlP38585 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TtlP38585 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TtlP38585 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TtlP38585 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TtlP38585 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TtlP38585 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TtlP38585 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TtlP38585 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TtlP38585 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TtlP38585 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TtlP38585 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TtlP38585 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TtlP38585 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TtlP38585 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TtlP38585 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TtlP38585 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TtlP38585 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TtlP38585 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TtlP38585 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TtlP38585 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TtlP38585 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TtlP38585 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TtlP38585 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TtlP38585 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TtlP38585 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TtlP38585 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TtlP38585 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TtlP38585 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TtlP38585 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TtlP38585 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TtlP38585 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TtlP38585 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TtlP38585 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TtlP38585 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TtlP38585 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TtlP38585 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TtlP38585 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TtlP38585 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TtlP38585 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TtlP38585 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TtlP38585 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TtlP38585 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TtlP38585 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TtlP38585 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TtlP38585 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TtlP38585 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TtlP38585 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TtlP38585 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TtlP38585 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TtlP38585 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TtlP38585 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TtlP38585 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TtlP38585 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TtlP38585 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TtlP38585 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TtlP38585 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TtlP38585 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TtlP38585 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TtlP38585 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TtlP38585 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TtlP38585 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TtlP38585 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TtlP38585 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TtlP38585 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TtlP38585 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TtlP38585 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TtlP38585 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TtlP38585 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TtlP38585 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TtlP38585 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TtlP38585 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TtlP38585 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TtlP38585 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TtlP38585 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TtlP38585 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TtlP38585 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TtlP38585 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TtlP38585 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TtlP38585 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TtlP38585 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TtlP38585 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TtlP38585 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TtlP38585 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TtlP38585 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TtlP38585 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TtlP38585 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TtlP38585 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TtlP38585 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TtlP38585 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TtlP38585 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TtlP38585 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms