Protein–RNA interactions for Protein: P33435

Mmp13, Collagenase 3, mousemouse

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Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp13P33435 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mmp13P33435 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mmp13P33435 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mmp13P33435 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mmp13P33435 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mmp13P33435 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mmp13P33435 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp13P33435 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp13P33435 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp13P33435 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp13P33435 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp13P33435 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp13P33435 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp13P33435 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp13P33435 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp13P33435 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp13P33435 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp13P33435 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp13P33435 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp13P33435 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp13P33435 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp13P33435 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp13P33435 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp13P33435 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp13P33435 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp13P33435 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp13P33435 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp13P33435 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp13P33435 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp13P33435 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp13P33435 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp13P33435 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp13P33435 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp13P33435 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp13P33435 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Mmp13P33435 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp13P33435 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Mmp13P33435 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp13P33435 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mmp13P33435 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp13P33435 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Mmp13P33435 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp13P33435 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp13P33435 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Mmp13P33435 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Mmp13P33435 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp13P33435 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Mmp13P33435 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Mmp13P33435 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp13P33435 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Mmp13P33435 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp13P33435 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Mmp13P33435 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp13P33435 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp13P33435 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp13P33435 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp13P33435 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp13P33435 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp13P33435 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp13P33435 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp13P33435 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp13P33435 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp13P33435 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp13P33435 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp13P33435 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Mmp13P33435 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mmp13P33435 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Mmp13P33435 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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