Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Hoxc11P31313 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Hoxc11P31313 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Hoxc11P31313 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxc11P31313 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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