Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BgnP28653 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BgnP28653 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BgnP28653 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BgnP28653 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BgnP28653 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BgnP28653 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BgnP28653 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BgnP28653 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BgnP28653 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BgnP28653 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BgnP28653 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BgnP28653 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BgnP28653 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BgnP28653 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BgnP28653 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BgnP28653 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BgnP28653 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BgnP28653 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BgnP28653 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BgnP28653 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
BgnP28653 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BgnP28653 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BgnP28653 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BgnP28653 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BgnP28653 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BgnP28653 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BgnP28653 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BgnP28653 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BgnP28653 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BgnP28653 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BgnP28653 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BgnP28653 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BgnP28653 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BgnP28653 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BgnP28653 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
BgnP28653 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
BgnP28653 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BgnP28653 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
BgnP28653 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BgnP28653 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BgnP28653 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BgnP28653 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BgnP28653 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BgnP28653 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BgnP28653 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BgnP28653 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BgnP28653 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BgnP28653 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
BgnP28653 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BgnP28653 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BgnP28653 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BgnP28653 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BgnP28653 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BgnP28653 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BgnP28653 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
BgnP28653 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BgnP28653 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BgnP28653 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BgnP28653 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BgnP28653 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BgnP28653 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BgnP28653 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
BgnP28653 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
BgnP28653 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BgnP28653 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BgnP28653 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BgnP28653 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BgnP28653 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BgnP28653 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BgnP28653 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BgnP28653 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BgnP28653 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BgnP28653 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BgnP28653 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BgnP28653 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BgnP28653 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BgnP28653 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BgnP28653 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BgnP28653 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BgnP28653 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BgnP28653 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BgnP28653 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BgnP28653 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BgnP28653 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BgnP28653 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BgnP28653 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BgnP28653 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BgnP28653 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BgnP28653 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BgnP28653 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BgnP28653 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BgnP28653 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BgnP28653 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BgnP28653 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BgnP28653 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BgnP28653 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BgnP28653 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BgnP28653 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BgnP28653 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms