Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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PdgfraP26618 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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PdgfraP26618 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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PdgfraP26618 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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PdgfraP26618 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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PdgfraP26618 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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PdgfraP26618 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PdgfraP26618 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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