Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Eif3aP23116 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Eif3aP23116 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Eif3aP23116 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Eif3aP23116 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Eif3aP23116 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Eif3aP23116 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Eif3aP23116 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Eif3aP23116 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Eif3aP23116 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
Eif3aP23116 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
Eif3aP23116 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
Eif3aP23116 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Eif3aP23116 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Eif3aP23116 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Eif3aP23116 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Eif3aP23116 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Eif3aP23116 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Eif3aP23116 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Eif3aP23116 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Eif3aP23116 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Eif3aP23116 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Eif3aP23116 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Eif3aP23116 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Eif3aP23116 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Eif3aP23116 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Eif3aP23116 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Eif3aP23116 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Eif3aP23116 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Eif3aP23116 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Eif3aP23116 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Eif3aP23116 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Eif3aP23116 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Eif3aP23116 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Eif3aP23116 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Eif3aP23116 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Eif3aP23116 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Eif3aP23116 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Eif3aP23116 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Eif3aP23116 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Eif3aP23116 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Eif3aP23116 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Eif3aP23116 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Eif3aP23116 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Eif3aP23116 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms