Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irf1P15314 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Irf1P15314 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf1P15314 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf1P15314 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf1P15314 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf1P15314 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf1P15314 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irf1P15314 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irf1P15314 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Irf1P15314 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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