Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 4930533L02Rik-201ENSMUST00000194425 1160 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Gm44061-201ENSMUST00000203962 1195 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 AC140368.1-202ENSMUST00000226131 658 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Pate4-201ENSMUST00000034610 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Gm7489-201ENSMUST00000100666 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Gm14938-201ENSMUST00000119482 943 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Gm28721-201ENSMUST00000187649 918 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Trdn-207ENSMUST00000219931 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 AC133598.4-201ENSMUST00000224577 454 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 AC154806.5-202ENSMUST00000227217 1443 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Gm26563-202ENSMUST00000181152 1931 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Chrm1P12657 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Gm16440-201ENSMUST00000100900 1089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Gm21103-201ENSMUST00000112737 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Gm3047-201ENSMUST00000164069 822 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Gm3029-201ENSMUST00000168306 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Gm7876-201ENSMUST00000169465 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Gm3043-201ENSMUST00000170639 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Gm3650-201ENSMUST00000180600 747 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Olfr163-ps1-201ENSMUST00000205891 940 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Pmis2-201ENSMUST00000051495 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Gm42822-201ENSMUST00000200507 1529 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms