Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CatspereP0DP43 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms