Protein–RNA interactions for Protein: P04213

T-cell receptor beta chain V region C5 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04213 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P04213 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P04213 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
P04213 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P04213 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P04213 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P04213 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P04213 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P04213 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
P04213 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
P04213 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P04213 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P04213 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P04213 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P04213 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P04213 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P04213 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
P04213 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P04213 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P04213 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P04213 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
P04213 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
P04213 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
P04213 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
P04213 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
P04213 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P04213 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P04213 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P04213 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P04213 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P04213 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P04213 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
P04213 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
P04213 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
P04213 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P04213 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
P04213 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P04213 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P04213 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P04213 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P04213 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
P04213 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
P04213 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
P04213 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P04213 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P04213 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
P04213 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
P04213 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P04213 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P04213 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P04213 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P04213 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P04213 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P04213 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
P04213 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
P04213 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
P04213 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
P04213 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P04213 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P04213 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P04213 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P04213 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P04213 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P04213 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
P04213 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P04213 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P04213 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P04213 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P04213 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P04213 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P04213 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P04213 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P04213 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P04213 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P04213 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P04213 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P04213 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P04213 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P04213 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P04213 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P04213 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P04213 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P04213 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P04213 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P04213 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P04213 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P04213 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P04213 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P04213 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P04213 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P04213 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P04213 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P04213 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P04213 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P04213 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P04213 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P04213 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P04213 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P04213 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P04213 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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