Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Vamp4O70480 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms