Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Clk2O35491 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Clk2O35491 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Clk2O35491 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Clk2O35491 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Clk2O35491 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clk2O35491 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Clk2O35491 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
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Clk2O35491 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
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Clk2O35491 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clk2O35491 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Clk2O35491 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clk2O35491 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clk2O35491 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clk2O35491 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clk2O35491 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Clk2O35491 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clk2O35491 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Clk2O35491 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clk2O35491 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clk2O35491 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clk2O35491 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clk2O35491 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clk2O35491 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clk2O35491 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clk2O35491 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clk2O35491 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Clk2O35491 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms