Protein–RNA interactions for Protein: O08856

Ell, RNA polymerase II elongation factor ELL, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EllO08856 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EllO08856 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EllO08856 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EllO08856 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EllO08856 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EllO08856 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EllO08856 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EllO08856 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EllO08856 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EllO08856 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
EllO08856 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
EllO08856 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EllO08856 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EllO08856 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EllO08856 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EllO08856 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EllO08856 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EllO08856 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
EllO08856 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EllO08856 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EllO08856 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EllO08856 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
EllO08856 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
EllO08856 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EllO08856 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EllO08856 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EllO08856 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EllO08856 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EllO08856 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EllO08856 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EllO08856 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EllO08856 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EllO08856 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EllO08856 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EllO08856 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EllO08856 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EllO08856 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EllO08856 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
EllO08856 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EllO08856 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EllO08856 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
EllO08856 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
EllO08856 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EllO08856 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EllO08856 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EllO08856 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EllO08856 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EllO08856 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EllO08856 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EllO08856 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EllO08856 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EllO08856 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EllO08856 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EllO08856 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EllO08856 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EllO08856 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
EllO08856 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
EllO08856 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EllO08856 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
EllO08856 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
EllO08856 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EllO08856 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EllO08856 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EllO08856 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EllO08856 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EllO08856 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EllO08856 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EllO08856 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EllO08856 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EllO08856 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EllO08856 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EllO08856 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EllO08856 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EllO08856 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
EllO08856 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
EllO08856 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
EllO08856 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
EllO08856 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
EllO08856 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
EllO08856 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
EllO08856 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
EllO08856 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
EllO08856 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
EllO08856 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
EllO08856 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
EllO08856 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
EllO08856 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
EllO08856 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
EllO08856 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
EllO08856 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
EllO08856 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
EllO08856 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
EllO08856 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
EllO08856 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
EllO08856 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
EllO08856 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
EllO08856 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
EllO08856 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
EllO08856 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
EllO08856 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms