Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm20878L7N244 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm20878L7N244 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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