Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20939L7N243 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20939L7N243 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20939L7N243 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20939L7N243 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20939L7N243 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20939L7N243 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20939L7N243 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20939L7N243 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20939L7N243 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20939L7N243 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20939L7N243 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20939L7N243 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20939L7N243 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20939L7N243 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20939L7N243 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20939L7N243 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20939L7N243 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20939L7N243 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20939L7N243 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20939L7N243 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20939L7N243 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20939L7N243 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20939L7N243 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20939L7N243 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20939L7N243 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20939L7N243 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20939L7N243 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20939L7N243 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20939L7N243 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20939L7N243 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20939L7N243 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20939L7N243 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20939L7N243 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20939L7N243 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20939L7N243 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20939L7N243 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20939L7N243 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20939L7N243 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20939L7N243 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20939L7N243 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20939L7N243 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20939L7N243 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20939L7N243 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20939L7N243 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20939L7N243 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20939L7N243 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20939L7N243 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20939L7N243 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20939L7N243 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20939L7N243 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20939L7N243 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20939L7N243 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20939L7N243 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20939L7N243 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20939L7N243 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20939L7N243 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20939L7N243 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20939L7N243 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20939L7N243 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20939L7N243 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20939L7N243 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20939L7N243 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20939L7N243 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20939L7N243 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20939L7N243 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20939L7N243 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20939L7N243 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20939L7N243 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20939L7N243 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20939L7N243 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20939L7N243 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20939L7N243 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20939L7N243 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20939L7N243 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20939L7N243 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20939L7N243 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20939L7N243 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20939L7N243 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20939L7N243 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20939L7N243 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20939L7N243 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20939L7N243 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20939L7N243 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20939L7N243 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20939L7N243 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20939L7N243 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20939L7N243 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20939L7N243 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20939L7N243 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20939L7N243 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20939L7N243 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20939L7N243 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20939L7N243 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20939L7N243 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20939L7N243 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20939L7N243 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20939L7N243 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20939L7N243 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm20939L7N243 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
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