Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm2035J3QP87 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms