Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem200cJ3QK46 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem200cJ3QK46 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem200cJ3QK46 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem200cJ3QK46 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem200cJ3QK46 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem200cJ3QK46 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem200cJ3QK46 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem200cJ3QK46 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem200cJ3QK46 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem200cJ3QK46 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem200cJ3QK46 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem200cJ3QK46 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem200cJ3QK46 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem200cJ3QK46 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem200cJ3QK46 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem200cJ3QK46 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem200cJ3QK46 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem200cJ3QK46 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem200cJ3QK46 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem200cJ3QK46 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem200cJ3QK46 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem200cJ3QK46 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem200cJ3QK46 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem200cJ3QK46 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem200cJ3QK46 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem200cJ3QK46 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem200cJ3QK46 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem200cJ3QK46 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem200cJ3QK46 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem200cJ3QK46 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem200cJ3QK46 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem200cJ3QK46 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem200cJ3QK46 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem200cJ3QK46 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem200cJ3QK46 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem200cJ3QK46 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem200cJ3QK46 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem200cJ3QK46 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem200cJ3QK46 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem200cJ3QK46 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem200cJ3QK46 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem200cJ3QK46 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem200cJ3QK46 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem200cJ3QK46 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem200cJ3QK46 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem200cJ3QK46 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem200cJ3QK46 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem200cJ3QK46 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem200cJ3QK46 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem200cJ3QK46 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem200cJ3QK46 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem200cJ3QK46 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem200cJ3QK46 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem200cJ3QK46 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem200cJ3QK46 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem200cJ3QK46 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem200cJ3QK46 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem200cJ3QK46 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem200cJ3QK46 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem200cJ3QK46 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem200cJ3QK46 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem200cJ3QK46 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem200cJ3QK46 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem200cJ3QK46 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem200cJ3QK46 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem200cJ3QK46 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem200cJ3QK46 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem200cJ3QK46 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem200cJ3QK46 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem200cJ3QK46 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem200cJ3QK46 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem200cJ3QK46 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem200cJ3QK46 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem200cJ3QK46 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem200cJ3QK46 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem200cJ3QK46 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem200cJ3QK46 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem200cJ3QK46 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem200cJ3QK46 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem200cJ3QK46 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem200cJ3QK46 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem200cJ3QK46 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem200cJ3QK46 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem200cJ3QK46 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem200cJ3QK46 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem200cJ3QK46 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem200cJ3QK46 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem200cJ3QK46 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem200cJ3QK46 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem200cJ3QK46 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem200cJ3QK46 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem200cJ3QK46 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem200cJ3QK46 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem200cJ3QK46 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem200cJ3QK46 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem200cJ3QK46 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem200cJ3QK46 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem200cJ3QK46 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem200cJ3QK46 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms