Protein–RNA interactions for Protein: G3UX18

Gm20726, Predicted gene, 20726, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20726G3UX18 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20726G3UX18 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20726G3UX18 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20726G3UX18 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20726G3UX18 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20726G3UX18 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20726G3UX18 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20726G3UX18 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20726G3UX18 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20726G3UX18 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20726G3UX18 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20726G3UX18 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20726G3UX18 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20726G3UX18 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20726G3UX18 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20726G3UX18 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20726G3UX18 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20726G3UX18 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20726G3UX18 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20726G3UX18 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20726G3UX18 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20726G3UX18 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20726G3UX18 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20726G3UX18 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20726G3UX18 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20726G3UX18 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20726G3UX18 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20726G3UX18 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20726G3UX18 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20726G3UX18 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20726G3UX18 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20726G3UX18 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20726G3UX18 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20726G3UX18 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20726G3UX18 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20726G3UX18 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20726G3UX18 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20726G3UX18 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20726G3UX18 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20726G3UX18 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20726G3UX18 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20726G3UX18 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20726G3UX18 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20726G3UX18 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20726G3UX18 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20726G3UX18 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20726G3UX18 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20726G3UX18 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20726G3UX18 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20726G3UX18 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20726G3UX18 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20726G3UX18 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20726G3UX18 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20726G3UX18 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20726G3UX18 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20726G3UX18 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20726G3UX18 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20726G3UX18 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm20726G3UX18 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm20726G3UX18 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm20726G3UX18 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm20726G3UX18 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm20726G3UX18 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm20726G3UX18 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm20726G3UX18 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm20726G3UX18 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm20726G3UX18 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm20726G3UX18 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm20726G3UX18 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm20726G3UX18 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm20726G3UX18 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm20726G3UX18 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm20726G3UX18 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm20726G3UX18 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm20726G3UX18 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm20726G3UX18 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm20726G3UX18 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm20726G3UX18 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm20726G3UX18 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm20726G3UX18 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm20726G3UX18 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm20726G3UX18 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm20726G3UX18 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm20726G3UX18 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm20726G3UX18 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm20726G3UX18 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm20726G3UX18 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm20726G3UX18 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm20726G3UX18 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm20726G3UX18 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm20726G3UX18 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm20726G3UX18 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm20726G3UX18 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm20726G3UX18 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm20726G3UX18 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm20726G3UX18 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm20726G3UX18 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm20726G3UX18 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm20726G3UX18 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm20726G3UX18 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms