Protein–RNA interactions for Protein: F8VPX6

Speer4a, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4aF8VPX6 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Speer4aF8VPX6 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms