Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Gm14539-201ENSMUST00000117527 174 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
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Gm28038F7BCN9 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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Gm28038F7BCN9 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Milr1-202ENSMUST00000106794 1514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm28038F7BCN9 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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