Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Ccdc71lE9Q4T4 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Ccdc71lE9Q4T4 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ccdc71lE9Q4T4 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
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Ccdc71lE9Q4T4 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Ccdc71lE9Q4T4 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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