Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gcom1E9PZ54 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.4 ms