Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Brd1E9PZ26 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Brd1E9PZ26 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms