Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms