Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Samd1D3YXK1 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms