Protein–RNA interactions for Protein: D3YXE9

BC048679, cDNA sequence BC048679, mousemouse

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC048679D3YXE9 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
BC048679D3YXE9 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC048679D3YXE9 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC048679D3YXE9 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC048679D3YXE9 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC048679D3YXE9 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC048679D3YXE9 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC048679D3YXE9 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC048679D3YXE9 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC048679D3YXE9 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC048679D3YXE9 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC048679D3YXE9 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC048679D3YXE9 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC048679D3YXE9 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC048679D3YXE9 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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BC048679D3YXE9 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC048679D3YXE9 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
BC048679D3YXE9 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC048679D3YXE9 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC048679D3YXE9 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC048679D3YXE9 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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BC048679D3YXE9 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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BC048679D3YXE9 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
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BC048679D3YXE9 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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BC048679D3YXE9 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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BC048679D3YXE9 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC048679D3YXE9 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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BC048679D3YXE9 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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BC048679D3YXE9 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
BC048679D3YXE9 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC048679D3YXE9 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
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BC048679D3YXE9 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC048679D3YXE9 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC048679D3YXE9 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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