Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Gm8298-201ENSMUST00000179799 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Olfr1315-ps1-201ENSMUST00000207542 1230 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Defa-ps4-201ENSMUST00000118021 183 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Olfr1038-ps-201ENSMUST00000149775 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Vmn1r231-201ENSMUST00000061278 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Krtap9-1-201ENSMUST00000093936 1044 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Apba1B2RUJ5 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms