Protein–RNA interactions for Protein: B2RQY6

BC035947, BC035947 protein, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC035947B2RQY6 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC035947B2RQY6 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC035947B2RQY6 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC035947B2RQY6 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC035947B2RQY6 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC035947B2RQY6 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC035947B2RQY6 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC035947B2RQY6 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC035947B2RQY6 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC035947B2RQY6 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC035947B2RQY6 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC035947B2RQY6 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC035947B2RQY6 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC035947B2RQY6 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC035947B2RQY6 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
BC035947B2RQY6 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC035947B2RQY6 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC035947B2RQY6 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC035947B2RQY6 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC035947B2RQY6 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC035947B2RQY6 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC035947B2RQY6 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC035947B2RQY6 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC035947B2RQY6 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC035947B2RQY6 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC035947B2RQY6 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC035947B2RQY6 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC035947B2RQY6 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC035947B2RQY6 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
BC035947B2RQY6 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
BC035947B2RQY6 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC035947B2RQY6 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
BC035947B2RQY6 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC035947B2RQY6 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC035947B2RQY6 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC035947B2RQY6 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC035947B2RQY6 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC035947B2RQY6 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC035947B2RQY6 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC035947B2RQY6 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC035947B2RQY6 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC035947B2RQY6 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC035947B2RQY6 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC035947B2RQY6 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC035947B2RQY6 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC035947B2RQY6 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC035947B2RQY6 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC035947B2RQY6 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC035947B2RQY6 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC035947B2RQY6 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
BC035947B2RQY6 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
BC035947B2RQY6 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
BC035947B2RQY6 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC035947B2RQY6 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC035947B2RQY6 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC035947B2RQY6 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC035947B2RQY6 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC035947B2RQY6 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC035947B2RQY6 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC035947B2RQY6 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC035947B2RQY6 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC035947B2RQY6 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC035947B2RQY6 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC035947B2RQY6 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC035947B2RQY6 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC035947B2RQY6 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC035947B2RQY6 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
BC035947B2RQY6 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC035947B2RQY6 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC035947B2RQY6 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC035947B2RQY6 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC035947B2RQY6 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
BC035947B2RQY6 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC035947B2RQY6 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC035947B2RQY6 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC035947B2RQY6 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
BC035947B2RQY6 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC035947B2RQY6 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC035947B2RQY6 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC035947B2RQY6 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC035947B2RQY6 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC035947B2RQY6 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC035947B2RQY6 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC035947B2RQY6 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC035947B2RQY6 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC035947B2RQY6 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC035947B2RQY6 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
BC035947B2RQY6 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC035947B2RQY6 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC035947B2RQY6 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC035947B2RQY6 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC035947B2RQY6 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC035947B2RQY6 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC035947B2RQY6 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC035947B2RQY6 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
BC035947B2RQY6 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC035947B2RQY6 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC035947B2RQY6 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC035947B2RQY6 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
BC035947B2RQY6 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms