Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Grik3B1AS29 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms