Protein–RNA interactions for Protein: A2ASQ1

Agrn, Agrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,950 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AgrnA2ASQ1 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
AgrnA2ASQ1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
AgrnA2ASQ1 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
AgrnA2ASQ1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
AgrnA2ASQ1 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
AgrnA2ASQ1 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
AgrnA2ASQ1 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
AgrnA2ASQ1 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
AgrnA2ASQ1 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
AgrnA2ASQ1 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
AgrnA2ASQ1 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
AgrnA2ASQ1 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
AgrnA2ASQ1 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
AgrnA2ASQ1 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
AgrnA2ASQ1 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
AgrnA2ASQ1 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
AgrnA2ASQ1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
AgrnA2ASQ1 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
AgrnA2ASQ1 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
AgrnA2ASQ1 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
AgrnA2ASQ1 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
AgrnA2ASQ1 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
AgrnA2ASQ1 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
AgrnA2ASQ1 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
AgrnA2ASQ1 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
AgrnA2ASQ1 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
AgrnA2ASQ1 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
AgrnA2ASQ1 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
AgrnA2ASQ1 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
AgrnA2ASQ1 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
AgrnA2ASQ1 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
AgrnA2ASQ1 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
AgrnA2ASQ1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
AgrnA2ASQ1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
AgrnA2ASQ1 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
AgrnA2ASQ1 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
AgrnA2ASQ1 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
AgrnA2ASQ1 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
AgrnA2ASQ1 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
AgrnA2ASQ1 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
AgrnA2ASQ1 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
AgrnA2ASQ1 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
AgrnA2ASQ1 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
AgrnA2ASQ1 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
AgrnA2ASQ1 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
AgrnA2ASQ1 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
AgrnA2ASQ1 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
AgrnA2ASQ1 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
AgrnA2ASQ1 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
AgrnA2ASQ1 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
AgrnA2ASQ1 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
AgrnA2ASQ1 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
AgrnA2ASQ1 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
AgrnA2ASQ1 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
AgrnA2ASQ1 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
AgrnA2ASQ1 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
AgrnA2ASQ1 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
AgrnA2ASQ1 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
AgrnA2ASQ1 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
AgrnA2ASQ1 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
AgrnA2ASQ1 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
AgrnA2ASQ1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
AgrnA2ASQ1 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
AgrnA2ASQ1 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
AgrnA2ASQ1 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
AgrnA2ASQ1 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
AgrnA2ASQ1 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
AgrnA2ASQ1 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
AgrnA2ASQ1 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
AgrnA2ASQ1 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
AgrnA2ASQ1 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
AgrnA2ASQ1 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
AgrnA2ASQ1 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
AgrnA2ASQ1 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
AgrnA2ASQ1 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
AgrnA2ASQ1 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
AgrnA2ASQ1 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
AgrnA2ASQ1 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
AgrnA2ASQ1 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
AgrnA2ASQ1 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
AgrnA2ASQ1 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
AgrnA2ASQ1 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
AgrnA2ASQ1 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
AgrnA2ASQ1 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
AgrnA2ASQ1 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
AgrnA2ASQ1 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
AgrnA2ASQ1 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
AgrnA2ASQ1 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
AgrnA2ASQ1 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
AgrnA2ASQ1 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
AgrnA2ASQ1 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.34
AgrnA2ASQ1 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
AgrnA2ASQ1 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
AgrnA2ASQ1 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
AgrnA2ASQ1 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
AgrnA2ASQ1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
AgrnA2ASQ1 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
AgrnA2ASQ1 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
AgrnA2ASQ1 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
AgrnA2ASQ1 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms