Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms