Protein–RNA interactions for Protein: A2AHA7

Pramel3, Preferentially-expressed antigen in melanoma-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel3A2AHA7 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pramel3A2AHA7 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pramel3A2AHA7 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pramel3A2AHA7 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pramel3A2AHA7 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pramel3A2AHA7 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pramel3A2AHA7 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pramel3A2AHA7 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pramel3A2AHA7 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pramel3A2AHA7 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pramel3A2AHA7 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pramel3A2AHA7 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pramel3A2AHA7 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pramel3A2AHA7 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pramel3A2AHA7 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pramel3A2AHA7 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pramel3A2AHA7 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pramel3A2AHA7 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pramel3A2AHA7 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pramel3A2AHA7 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pramel3A2AHA7 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pramel3A2AHA7 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pramel3A2AHA7 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pramel3A2AHA7 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pramel3A2AHA7 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pramel3A2AHA7 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pramel3A2AHA7 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pramel3A2AHA7 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pramel3A2AHA7 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pramel3A2AHA7 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramel3A2AHA7 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramel3A2AHA7 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramel3A2AHA7 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramel3A2AHA7 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramel3A2AHA7 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramel3A2AHA7 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramel3A2AHA7 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramel3A2AHA7 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramel3A2AHA7 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramel3A2AHA7 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramel3A2AHA7 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramel3A2AHA7 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramel3A2AHA7 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramel3A2AHA7 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramel3A2AHA7 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramel3A2AHA7 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramel3A2AHA7 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramel3A2AHA7 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramel3A2AHA7 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramel3A2AHA7 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramel3A2AHA7 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramel3A2AHA7 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramel3A2AHA7 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramel3A2AHA7 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramel3A2AHA7 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramel3A2AHA7 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramel3A2AHA7 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramel3A2AHA7 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramel3A2AHA7 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramel3A2AHA7 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramel3A2AHA7 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramel3A2AHA7 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramel3A2AHA7 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramel3A2AHA7 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramel3A2AHA7 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramel3A2AHA7 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramel3A2AHA7 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramel3A2AHA7 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramel3A2AHA7 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramel3A2AHA7 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pramel3A2AHA7 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramel3A2AHA7 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramel3A2AHA7 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramel3A2AHA7 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramel3A2AHA7 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramel3A2AHA7 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramel3A2AHA7 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramel3A2AHA7 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramel3A2AHA7 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramel3A2AHA7 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramel3A2AHA7 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramel3A2AHA7 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramel3A2AHA7 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramel3A2AHA7 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramel3A2AHA7 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramel3A2AHA7 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramel3A2AHA7 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramel3A2AHA7 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramel3A2AHA7 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramel3A2AHA7 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramel3A2AHA7 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramel3A2AHA7 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pramel3A2AHA7 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pramel3A2AHA7 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pramel3A2AHA7 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pramel3A2AHA7 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pramel3A2AHA7 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pramel3A2AHA7 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pramel3A2AHA7 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pramel3A2AHA7 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms