Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Calcoco2A2A6M5 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms