Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Speer3W4VSP1 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Gm19080-201ENSMUST00000196082 550 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Gm29151-201ENSMUST00000196669 2513 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Speer3W4VSP1 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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