Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2I4

Robo3, Roundabout homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo3Q9Z2I4 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Robo3Q9Z2I4 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Robo3Q9Z2I4 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Robo3Q9Z2I4 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms