Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N6

Sfrp4, Secreted frizzled-related sequence protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp4Q9Z1N6 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sfrp4Q9Z1N6 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sfrp4Q9Z1N6 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sfrp4Q9Z1N6 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sfrp4Q9Z1N6 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sfrp4Q9Z1N6 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sfrp4Q9Z1N6 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sfrp4Q9Z1N6 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sfrp4Q9Z1N6 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sfrp4Q9Z1N6 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms