Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AmfrQ9R049 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AmfrQ9R049 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AmfrQ9R049 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AmfrQ9R049 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AmfrQ9R049 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AmfrQ9R049 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AmfrQ9R049 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AmfrQ9R049 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AmfrQ9R049 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AmfrQ9R049 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AmfrQ9R049 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AmfrQ9R049 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AmfrQ9R049 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AmfrQ9R049 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AmfrQ9R049 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AmfrQ9R049 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AmfrQ9R049 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AmfrQ9R049 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AmfrQ9R049 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AmfrQ9R049 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AmfrQ9R049 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AmfrQ9R049 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AmfrQ9R049 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AmfrQ9R049 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AmfrQ9R049 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AmfrQ9R049 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
AmfrQ9R049 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
AmfrQ9R049 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
AmfrQ9R049 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
AmfrQ9R049 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AmfrQ9R049 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AmfrQ9R049 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AmfrQ9R049 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AmfrQ9R049 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AmfrQ9R049 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AmfrQ9R049 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AmfrQ9R049 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AmfrQ9R049 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AmfrQ9R049 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AmfrQ9R049 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AmfrQ9R049 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AmfrQ9R049 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AmfrQ9R049 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms