Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phtf1Q9QZ09 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms