Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

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Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Kcnip3Q9QXT8 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Kcnip3Q9QXT8 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Kcnip3Q9QXT8 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Kcnip3Q9QXT8 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Kcnip3Q9QXT8 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Kcnip3Q9QXT8 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Kcnip3Q9QXT8 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Kcnip3Q9QXT8 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Kcnip3Q9QXT8 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
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