Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Homer2Q9QWW1 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms