Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rabgef1Q9JM13 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rabgef1Q9JM13 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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