Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ldb3Q9JKS4 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.2 ms