Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gfra4Q9JJT2 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gfra4Q9JJT2 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gfra4Q9JJT2 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gfra4Q9JJT2 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gfra4Q9JJT2 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gfra4Q9JJT2 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gfra4Q9JJT2 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gfra4Q9JJT2 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gfra4Q9JJT2 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gfra4Q9JJT2 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gfra4Q9JJT2 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gfra4Q9JJT2 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gfra4Q9JJT2 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gfra4Q9JJT2 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gfra4Q9JJT2 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gfra4Q9JJT2 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gfra4Q9JJT2 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gfra4Q9JJT2 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gfra4Q9JJT2 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gfra4Q9JJT2 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gfra4Q9JJT2 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gfra4Q9JJT2 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gfra4Q9JJT2 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfra4Q9JJT2 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfra4Q9JJT2 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfra4Q9JJT2 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfra4Q9JJT2 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfra4Q9JJT2 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfra4Q9JJT2 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfra4Q9JJT2 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfra4Q9JJT2 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfra4Q9JJT2 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfra4Q9JJT2 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfra4Q9JJT2 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfra4Q9JJT2 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfra4Q9JJT2 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfra4Q9JJT2 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfra4Q9JJT2 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfra4Q9JJT2 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfra4Q9JJT2 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfra4Q9JJT2 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfra4Q9JJT2 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfra4Q9JJT2 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfra4Q9JJT2 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfra4Q9JJT2 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfra4Q9JJT2 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfra4Q9JJT2 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfra4Q9JJT2 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gfra4Q9JJT2 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra4Q9JJT2 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra4Q9JJT2 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra4Q9JJT2 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra4Q9JJT2 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra4Q9JJT2 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra4Q9JJT2 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra4Q9JJT2 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra4Q9JJT2 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra4Q9JJT2 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra4Q9JJT2 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra4Q9JJT2 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra4Q9JJT2 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra4Q9JJT2 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra4Q9JJT2 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra4Q9JJT2 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra4Q9JJT2 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra4Q9JJT2 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra4Q9JJT2 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra4Q9JJT2 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra4Q9JJT2 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra4Q9JJT2 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra4Q9JJT2 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra4Q9JJT2 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra4Q9JJT2 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra4Q9JJT2 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra4Q9JJT2 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra4Q9JJT2 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra4Q9JJT2 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra4Q9JJT2 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra4Q9JJT2 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra4Q9JJT2 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra4Q9JJT2 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra4Q9JJT2 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra4Q9JJT2 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra4Q9JJT2 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra4Q9JJT2 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra4Q9JJT2 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra4Q9JJT2 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra4Q9JJT2 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra4Q9JJT2 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfra4Q9JJT2 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfra4Q9JJT2 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfra4Q9JJT2 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfra4Q9JJT2 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfra4Q9JJT2 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfra4Q9JJT2 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfra4Q9JJT2 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfra4Q9JJT2 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfra4Q9JJT2 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfra4Q9JJT2 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms