Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Riox1Q9JJF3 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms